Випадково в молоці знаходять гнильні, маслянокислі бактерії, протей та багато інших. Джерелами мікрофлори молока, крім паренхіми вимені, є: молочний посуд, трубопровід, шкіра вимені, руки дояра, корми, повітря тваринницьких приміщень.